وشظايا تقنية الحمض النووي المستنسخة متداخلة ويحدد هذا الجزء النموذج المستمر واحد من الكروموسوم. يمكن أن تتولد هذه الشظايا بقص عشوائي أو بالهضم الجزئي مع قطع أربعة-قاعدة-زوج مثل Sau 3A. هيبريديزيشنز سلسلة من مستعمرة ثم يجري، بدءاً ببعض الشظايا المستنسخة التي قد تحددت بالفعل، والذي هو معروف لتكون في المنطقة تشملها المستنسخين المتداخلة. يتم استخدام هذه الشظايا التي تم تحديدها مجس اقتطاف استنساخ تحتوي على تسلسلات المتاخمة. ثم يتم استخدام هذه كما يسبر أنفسهم للتعرف على الحيوانات المستنسخة تحمل متواليات المتاخمة لها وهلم جرا. في كل جولة من التهجين أحد "مناحي" كذلك على طول الكروموسوم من الشظايا الأولية.