جينات التي من المحتمل أن تكون موجودة في نفس المنطقة كعلامة الحمض النووي أظهرت أن تكون مرتبطة إلى سمة محور واحد أو إلى الحالة رقم الصفات كمية (QTL)، حيث الموقع المحتمل الجينات في الجينوم للأنواع المعنية يرتكز على موقعة المعروف في الخريطة من نوع آخر، أي، يستند إلى خريطة مقارنة بين النوعين.