تسلسل النوكليوتيدات-تتألف عادة من النيوكليوتيدات 4 أو 6 أو 8-يتم التعرف عليه بواسطة، والذي يربط قيود اندونوكليسي (إنزيم التقييد). لنوع إنزيمات التقييد الثاني (تلك التي تستخدم في تجارب الاستنساخ الجيني) هو أيضا في التسلسل ضمنه الإنزيم تخفيضات على وجه التحديد (وتلك الإنزيمات المناظرة ميثيلاتي) الحمض النووي، أي، للنوع الثاني الإنزيمات، الاعتراف بالموقع وموقع الهدف هي نفس تسلسل. النوع الأول من إنزيمات الربط إلى موقع الاعتراف بهم وتنشق ثم الحمض النووي في بعض الموقف أكثر أو أقل عشوائية خارج هذا الموقع الاعتراف.