Ein Polypeptid, gemacht aus einem rekombinanten gen, die Teile von zwei oder mehr verschiedenen Genen enthält. Der verschiedenen Gene sind miteinander verbunden, sodass ihre kodierende Sequenzen in der gleichen Leseraster sind: den genetischen Apparat liest die gen-Fusion als ein einzelnes Gen, und also ein Fusionsprotein produziert. Auch als Hybrid-Protein oder Chimären Protein. Dieser Proteine werden verwendet:

-Tag eine Affinität zu einem Protein;

Hinzufügen-ein Peptid als Teil eines größeren Proteins zu produzieren, die dann geschnitten wird, nachdem es wird durch das Klonen;

-zu produzieren, ein Protein mit der kombinierten Merkmale zwei natürliche Proteine; oder

- um ein Protein zu produzieren, wo zwei verschiedene Aktivitäten physisch verbunden sind.