Eine Methode zur Trennung von Nukleinsäure- oder Proteinmoleküle entsprechend ihrer molekularen Größe. Die Moleküle durch die inerten Gelmatrix unter dem Einfluss eines elektrischen Feldes zu migrieren. Bei Protein Seite, Detergenzien wie Natriumdodecylsulfat (SDS) werden häufig hinzugefügt, um sicherzustellen, dass alle Moleküle eine einheitliche Gebühr haben. Sekundäre Struktur kann oft zu der anomalen Migration von Molekülen führen. Darum ist es üblich, die Proteinproben denaturieren durch Kochen sie vor Seite . Bei Nukleinsäuren, Denaturierungsmittel wie Formamid, Harnstoff oder Methyl Quecksilberoxid Hydroxid fließen oft in das Gel selbst, die auch bei hohen Temperaturen ausgeführt werden kann. Seite wird verwendet, um die Produkte der DNA-Sequenzierung Reaktionen zu trennen und die Gele beschäftigt sind höchst Denaturierung, da der Moleküle in der Größe unterscheiden sich durch eine Einzel-Nukleotid gelöst werden müssen.