Τοξικές ουσίες που παράγονται από μύκητες ή καλούπια για τις γεωργικές καλλιέργειες που μπορεί να προκαλέσει την ασθένεια σε ζώα ή ανθρώπους που τρώνε ζωοτροφών ή τροφίμων από μολυσμένα καλλιέργειες. Υπάρχουν μεταξύ 300 και 400 γνωστές μυκοτοξίνες, αλλά μείζονος ενδιαφέροντος, με βάση την τοξικότητα και την εμφάνιση, είναι η αφλατοξίνη, vomitoxin, ζεαραλενόνη, funonisin, τοξίνη T-2 και τοξίνες T-2-όπως (τριχοθισίνες). GIPSA επί του παρόντος μέτρα για αφλατοξίνη σε όλες τις εξαγωγές αποστολές του καλαμποκιού, και μέτρα για αφλατοξίνης και vomitoxin σε εθελοντική βάση σε αποστολές εσωτερικού.