Σύντομο, μοναδικό ακολουθίας DNA (συνήθως 200 έως 500 bp), με το να είναι σε θέση να συμπληρωθούν με PCR, είναι μοναδικά «tagged» στην τοποθεσία για το χρωμόσωμα από την οποία αυτή ήταν να συμπληρωθούν.