YAC χρησιμοποιείται ως ένα σύστημα φορέα για την κλωνοποίηση των τεμαχίων DNA που μπορεί να είναι εκατοντάδες κιλοβάσεις μακρά. Γραμμική κλωνοποίηση διανύσματα κατασκευασμένα από ουσιώδη στοιχεία των χρωμοσωμάτων ζύμης. Μπορούν να φιλοξενήσουν τον ξένο DNA ένθετα από 200 έως 500 kb.