Restringir el movimiento de organismos (genéticamente) organizando las barreras para impedir que crece fuera del laboratorio. Contención biológica puede tomar dos formas: haciendo el organismo incapaz de sobrevivir en el ambiente exterior, o haciendo el ambiente exterior inhóspito para el organismo. Éste es raramente conveniente para bacterias, que, en principio, podrían sobrevivir en casi cualquier lugar. Así para bacterias y levaduras, el favorecido es mutar los genes en el organismo, por lo que requieren un suministro de nutrientes específicos que normalmente sólo está disponible en el laboratorio. Si ellos salgan, luego no pueden crecer. Haciendo el ambiente hostil para el organismo es en parte un control biológico, en parte una física. Por lo tanto, del primer arroz genéticamente las cepas se desarrollaron en Inglaterra (que es demasiado frío para cultivar el arroz) y probadas en el campo en Arizona (donde está demasiado seca). De contención biológica también puede implicar la utilización de moléculas de vector y organismos huéspedes que han sido desactivados genéticamente que pueden sobrevivir sólo en las peculiares condiciones exigidas por el experimentador y que no están disponibles fuera del laboratorio.