Tüübi DNA-marker, seedimist genoomse DNA kaks piirangut ensüümide luua palju DNA fragmente, ligation teatud järjestusi DNA (nn adapterid) Need pikad otsad amplifikatsiooni fragmendid PCR (krundid komplekti abil vastavat adapterit, pluss kolm täiendavad alused end juhuslikult kombinatsioone järjestused) kaudu loodud, ja kildude kaudu geelelektroforees visualiseerimine. The PCR võimendavad iga fragmendi, kelle jada juhtub alustada mis tahes kolme-base järjestused krundid komplekti. AFLPs on oluline eelis, et paljud markerid saab suhteliselt vähese vaevaga loodud. Nad on väga kasulik vahend kvantifitseerimine ja nende populatsioonide vahel geneetilise mitmekesisuse ulatus . Saavad suureks Miinuseks on see, et nad ei ole seotud konkreetse lookuse ja kuna nad on poolitusjoonega olemasolu või puudumine on bänd, heterozygotes ei saa eristada homozygotes, s.t, nad on pärinud valitsev mood.