Une forme de VNTR (q.v.). Plus précisément, un segment d'ADN caractérisée par la survenue d'un nombre variable de copies (de quelques-uns jusqu'à 30 ou plus) d'une séquence d'autour de 5 ou moins de base (appelé une unité de répétition, q.v.). A microsatellite typique est l'unité de répétition AC, qui se produit à environ 100 000 sites différents dans un génome de mammifères typique. Sur tout un site (locus), il y a généralement plusieurs « allèles différents, » chacun identifiables selon le nombre d'unités répétées. Ces allèles peuvent être détectés par PCR (q.v.), à l'aide d'amorces conçues à partir de la séquence unique qui se trouve de chaque côté du microsatellite. Lors de la PCR le produit est exécuté sur un gel d'électrophorèse, allèles peuvent être vus diffèrent en longueur en unités égal à la taille de l'unité de répétition, par exemple, si les amorces correspondent à la séquence unique immédiatement de chaque côté du microsatellite chaque 20 bases depuis longtemps et sont un individu est hétérozygote pour un C.A. microsatellites avec un allèle comprenant 5 répétitions et l'autre comprenant 6 répétitions, l'hétérozygote exposera deux bandes sur le gel, une bande étant 20 + (2 × 5) + 20 = 50 bases depuis longtemps et l'autre allèle étant 20 + (2 × 6) + 20 = 52 bases longues. Microsatellites ont été le marqueur d'ADN standard : elles sont facilement détectables par PCR, et ils ont tendance à être uniformément à travers le génome. Des milliers ont été cartographiées chez de nombreuses espèces différentes.