Berdasarkan kisah legenda yang ada, nama kota Manado berasal dari bahasa Etnik Toutemboan Minahasa, yaitu "Manarow", yang berarti "Pergi ke Negeri Jauh".

Nama lain yang lebih tua untuk Manado adalah "Wenang/Benang". Wenang atau Benang merupakan nama pohon yang banyak tumbuh di pesisir Manado dan dapat ditemukan di sepanjang pantai di Bahu Malalayang hingga Kalasey.