Dilatarbelakangi oleh peristiwa pembentukan pos pemerintahan pertama di Manokwari yang dilakukan oleh Pemerintahan Hindia Belanda pada tanggal 8 November 1898, Manokwari menggunakan tanggal tersebut sebagai hari jadinya.

Manokwari merupakan salah satu kota yang bersejarah bagi para penganut agama Kristen di Papua karena dahulu ada dua orang penginjil yang mendarat di Pulau Mansinam dan memulai penyebaran Kristen Protestan di sana.