Una forma di VNTR (q.v.) in cui l'unità ripetute (q.v.) in genere varia da 10 a 100 basi. Essi sono solitamente rilevate tramite l'ibridazione del sud (q.v.), utilizzando una sonda che comprende un clone dell'unità di ripetizione. Il primo DNA le impronte digitali (q.v.) erano minisatelliti rilevati in questo modo. Minisatelliti tendono ad essere situati alle estremità dei cromosomi e nelle regioni con un'alta frequenza di ricombinazione.