Un'endonucleasi di restrizione II tipo che lega (e successivamente fende) DNA in siti che contengono una sequenza di sei coppie di nucleotidi che viene riconosciuta in modo univoco di tale enzima. Perché qualsiasi sequenza di sei basi si verifica meno frequentemente di possibilità rispetto a qualsiasi sequenza delle quattro basi, sei-base frese fendono meno frequentemente rispetto ai quattro-base frese. Così, sei-base tagliatori creare frammenti più grandi rispetto a quattro-base frese.