Un set di tre nulecotides per cui non c' non è nessuna molecola di tRNA corrispondente per inserire un amminoacido nella catena polipeptidica. Proteina sintesi quindi sono terminata e il polipeptide completato rilasciato dal ribosoma. Fermata tre codoni sono trovati: UAA (ocra), UAG (ambra) e UGA (opale). Mutazioni che generano uno qualsiasi di questi tre codoni in una posizione che normalmente contiene un codone che specifica un aminoacido sono note come mutazioni di assurdità. Stop codoni possono essere chiamati anche codoni nonsenso.