תנאי ריאקציה - ובמיוחד טמפרטורה, concentration(s) מלח ו- pH - מכתיב עבור חישול של חד גדילי DNA/ה-DNA, ה-DNA/RNA ו- RNA/RNA כלאיים. ב ערך גבוה, דופלקסים טופס רק בין גדילי עם המושלם אשר ליחיד; ערך נמוך יותר מאפשר עבור חישול בין גדילי עם מידה מסוימת של חוסר התאמה בין בסיסים.