התהליך לפיו רצף transposon או ההכנסה מוסיף עצמה לתוך אתר חדש זהה או אחרת מולקולת ה-DNA. בדיוק מנגנון אינה מובנת במלואה, טרנספוזונים שונים עשויים לשקף על ידי מנגנונים שונים. טרנספוזיציה של חיידקים אינו דורש הומולוגיה נרחבת DNA בין transposon את המטרה הדנ א. התופעה מתואר ולכן לגיטימי רקומבינציה.