종 간의 유전자 지도 위치를 비교 하면서. 이러한 비교의 결과 나타내는 유전자의 블록 및 종족 간의 염색체의 심지어 큰 세그먼트의 실질적인 보존. 위대한 사용 지도 위치이 절약 할 수 있다. 예를 들어, 포유류, 뜻의 경우는 유전자를 심각 하 게 매핑된 종 (인간과 마우스) 중 하나 또는 모두에 매핑된 경우 다음 다른 포유류에서 그 유전자의 가능성이 위치 예측할 수 있는 상당한 자신감을가지고. 반대로 매핑된 익명 DNA 마커는 양적 특성 (이 고 양적 특성 로커 스 (QTL)에 연결 되는 표식 직 설법)에 영향을 경우, 말, 가축, 다음 지식의 가축과 인간 사이의 비교 지도 식별할 수 있는 유전자는 QTL 일치 수 있는 인간 게놈의 동종 지역에. 같은 유전자 비교 위치 후보 유전자 (q.v.) 이라고 합니다.