뉴클레오티드 순서-4, 6 또는 8 뉴클레오티드-금지 endonuclease (제한 효소)를 결속 하 고 인정 되는 일반적으로 이루어져 있습니다. 형식에 대 한 II 제한 효소 (유전자 복제 실험에 사용 된) 또한 시퀀스는 효소 특히 인하 (및 그들의 해당 효소 methylate)은 DNA, 즉, 유형 II 효소에 대 한 인식 사이트와 대상 사이트는 동일한 시퀀스. 유형 I 효소 그들의 인식 사이트에 바인딩할 및 다음 해당 인식 사이트 밖에 서 몇 가지 더 많거나 적은 임의의 위치에서 DNA를 쪼개 다.