Savienojums, kas nogalina organismu, pamatojoties uz īpašo bioloģisko ietekmi nevis kā plašākā ķīmiskās indes. Konkrētu veidu iekļaut bio-insekticīdi un bioloģisko fungicīdu. Bioloģisko pesticīdu atšķiras no biokontroles aģenti, ka bioloģisko pesticīdu ir pasīva pārstāvji, tā kā biokontroles pārstāvji aktīvi meklējot kaitēkļu jāiznīcina. Ir daži ļoti pievilcīgs anti-pest materiāli, piemēram, Bacillus thuringiensis (Bt) toksīnu, kas tieši traucē pārtiku no iekšas dažas kukaiņu absorbcijas, bet ir nekaitīgs zīdītājiem. Racionālais attīstīt bio-pesticīdu ir tā, ka viņi ir lielāka iespēja tikt bioloģiski un ir vērsti uz konkrētu elementu kaitēkļu vielmaiņu.