Notekūdeņu apstrāde ir viens no izplatītākajiem biotehnoloģisko procesu rietumu sabiedrībās, lai tiktu galā ar cilvēku un dzīvnieku izcelsmes atkritumus, kas šādu sabiedrību radītu milzīgas summas. Notekūdeņu apstrādes metodes var ievērojami atšķirties, taču visiem ir bioloģisko pamatu sadalīt notekūdeņu bioloģisko materiālu un pārvērst to par kaut ko, ka varat droši novada vidē (parasti upēm vai jūras).