Een plasmide kan repliceren in twee verschillende gastheerorganismen omdat het draagt twee verschillende oorsprong van replicatie en kan daarom worden gebruikt om 'shuttle' genen van de ene naar de andere. Bijvoorbeeld de YEp, pJDB219, is een shuttle vector kan repliceren E. coli uit zijn pMB9 oorsprong en in Saccaromycs cerevisiae van zijn 2 µm-plasmide oorsprong.