De single-stranded nucleotide sequentie links op een fragment van de beperking per type II restrictie-enzymen die snijden van elk onderdeel op een andere locatie. Deze ongepaarde regio's zijn beschikbaar voor hybridisatie met aanvullende eindigt op andere fragmenten tijdens het maken van recombinant DNA. aka uitstekende einde overhang; samenhangende einde.