De to trådene som utgjør DNA blir holdt sammen av bestemte hydrogen bonding mellom purines og pyrimidines (A par med T; og G parene med C). Størrelsen på et nucleic acid molekylet er ofte beskrevet i forhold til antall base parene (symbol: bp) eller tusen base-parene (kilobase parene; symbol: kb, en mer praktisk enhet) den inneholder.