Deoxynucleotides som mangler en 3´-hydroksyl gruppe, og er dermed i stand til å danne 3´ 5´ phospho-diester bånd som er nødvendig for kjeden forlengelse. Di-deoxynucleotides brukes i DNA sekvensering og behandling av sykdommer. Også noen ganger referert til som gjorde ikke.