O processo que começa com a busca de marcadores ligados para uma determinada característica herdada, em seguida, utilizando os marcadores para identificar a localização aproximada do gene responsável para o traço e, em seguida, usando várias estratégias de clonagem (incluindo cromossomos andando, q.v.) para identificar, isolar e caracterizar o gene. Originalmente, a estratégia foi chamada genética reversa, um termo que alguns consideram para ser um nome impróprio e enganosa.