Tratamento de esgoto é um dos processos biotecnológicos mais difundidos nas sociedades ocidentais, para lidar com as enormes quantidades de resíduos humanos e animais que produzem de tais sociedades. Métodos de tratamento de esgoto de variam muito, mas todos têm uma base biológica para decompor o material orgânico no esgoto e convertê-lo em algo que pode com segurança ser lançada no meio (geralmente de rios ou mares).