Sekwencji szczególne nukleotydów w DNA, który jest rozpoznawany przez endonukleazy typu II i która sprawia, że cięcia podwójnej nici. Ograniczenie miejsc zazwyczaj składają się cztery lub sześć par podstawy, które zazwyczaj są Palindrom (połączone), np., 5´GGCC3´

3´CCGG5´

te dwa aspekty mogą być cięte albo naprzeciwko siebie, aby utworzyć tępych końców, lub w sposób rozłożone, dając Przyklejony kończy, w zależności od enzymu udział.