O moleculă de ADN dublu catenar sau ARN ADN-hibrid, în cazul în care fiecare fir este de o origine diferită, şi, prin urmare, care conţine unul sau mai multe nepotrivite perechi de bază (non-complementare). A ADN-ului duplex este pregătit de hibridizare de molecule de ADN-ul singur-stranded derivate din două surse diferite. În cazul în care DNAs doi au identice sau foarte asemănătoare secvenţe, o molecula de dublu-stranded va fi stabilit, întrucât, în cazul în care două DNAs diferă în secvenţă, singur-stranded regiuni vor rămâne. Un heteroduplex va fi dezvăluit ca singur-componenta "tufisuri" atunci când ADN-ul se observă la microscop de electroni. Harta omoloage şi non-omoloage regiunile dintre cele două molecule astfel pot fi construite. Acest proces este cunoscut ca heteroduplex de cartografiere.