Postopki za določanje nukleotidnega zaporedja DNK fragmenta. Obstajajo dve skupne metode za to:

• Maxam in Gilbert tehnika (kemične razgradnje), ki uporablja različne kemikalije za prekinitev DNA v fragmente na posebnih podlagah; ali

• Sanger tehnika (imenovano di-deoxy ali prekinitev verige metode) uporablja DNK-polimerazo narediti novo DNA verige, z nukleotidi di-deoxy (veriga Terminatorji) za ustavitev verige naključno, saj raste.

V obeh primerih fragmentov DNA ločene po dolžini ga poliakrilamidnem gelu, ki omogočajo zaporedje čitati neposredno iz gela.