Förfaranden som införs nonrandom enda plats ändringar i strukturella gener (platsspecifika mutagenes) för att producera muterade gener som kan kopplas till initiativtagarna att direkt syntes av ett specifikt förändrat protein, som sedan analyseras för strukturella och funktionella egenskaper och jämförs sedan med de förutsedda och eftertraktade egenskaperna. Utformningen av proteinet får biträdas av dator grafisk teknik och andra avancerade molekylär modellering teknik.