Särskilda nukleotidsekvensen i DNA som är erkänd av en typ II begränsning Amiiiiin och inom vilket det gör ett dubbelsträngat snitt. Begränsning platser brukar bestå av fyra eller sex baspar som vanligtvis är palindromic (se),

t.ex., 5´GGCC3´

3´CCGG5´

de två delarna kan vara avskurna antingen mittemot varandra, att skapa trubbiga ändar, eller i ett utspritt sätt, ge klibbiga slutar, beroende på enzymet som är inblandade.