ระบบชื่อและหมายเลขที่ระบุเป็นเอนไซม์ในวรรณคดีทางเทคนิค กำหนด โดยการเสริมเอนไซม์ หมายเลข EC ประกอบด้วยตัวเลขสี่ตัวคั่น ด้วยจุด: แรกประมวลเอนไซม์ที่เป็นหนึ่งในกลุ่มอย่างกว้าง ๆ หก: 1. Oxidoreductase 2. Transferases 3. ไฮโดรเลส 4. Lyases 5. Isomerases 6. Ligases แต่ละกลุ่มคือ subdivided เป็น sub-groups แต่ละ sub-group ใน sub-sub-groups และหมายเลขสุดท้ายจะเฉพาะเจาะจงสำหรับเอนไซม์ เช่น EC 3.1.21.1 เป็น deoxyribonuclease ฉัน