Thủ tục để xác định chuỗi nucleotide một mảnh DNA. Có hai phương pháp phổ biến để làm điều này:

• Maxam và Gilbert kỹ thuật (suy thoái hóa học), sử dụng các hóa chất khác nhau để phá vỡ các DNA thành mảnh tại căn cứ cụ thể; hoặc

• kỹ thuật Sanger (được gọi là di deoxy hoặc chấm dứt chuỗi phương pháp) sử dụng các ADN polymerase để làm mới các chuỗi DNA, với di-deoxy nucleotide (chuỗi terminators) để ngăn chặn các chuỗi ngẫu nhiên như nó phát triển.

Trong cả hai trường hợp, những đoạn DNA được tách ra theo chiều dài của polyacrylamide gel điện, cho phép trình tự để được đọc trực tiếp từ gel.