Một phương pháp để tách các phân tử bằng cách khai thác khả năng của mình để liên kết đặc biệt với các phân tử khác. Có một số loại sắc ký sinh mối quan hệ. A phân tử sinh học có thể được immobilized và một phân tử nhỏ hơn (ligand, cuộc,) mà nó là liên kết có thể bị mắc kẹt với nó, hay phối tử nhỏ hơn có thể được ta và macromolecule mắc kẹt với nó. A Phiên bản là sử dụng một kháng thể như là các phân tử immobilized và sử dụng nó để "nắm bắt" kháng nguyên của nó: điều này thường được gọi là sắc mối quan hệ miễn dịch. A biến thể là sắc kí pseudo-affinity, trong đó một hợp chất mà là giống như một ligand sinh học ta vào một vật liệu rắn, và enzym hoặc protein khác đang bị ràng buộc để nó. Kỹ thuật khác bao gồm mối quan hệ kim loại sắc, nơi một ion kim loại ta trên một hỗ trợ vững chắc: kim loại ion ràng buộc chặt chẽ và đặc biệt đến nhiều biomolecules. Kim loại ion là ràng buộc để một nhóm chelator hoặc chelating, một nhóm hóa học liên kết đặc biệt và rất chặt chẽ với các kim loại đó.