Một đôi-stranded DNA phân tử hoặc kết hợp DNA-RNA, nơi từng sợi là một nguồn gốc khác nhau, và do đó có chứa một hoặc nhiều mismatched cặp cơ sở (phòng không bổ sung). A DNA kép được chuẩn bị bởi lai ghép của các phân tử DNA duy nhất-stranded bắt nguồn từ hai nguồn khác nhau. Nơi hai DNAs có giống hệt hoặc tương tự như trình tự, một phân tử đôi-stranded sẽ được thành lập, trong khi nơi DNAs hai khác nhau trong chuỗi, đơn-stranded vùng sẽ vẫn. Heteroduplex một sẽ được tiết lộ như là đĩa đơn lõi "bụi" khi DNA quan sát điện tử microscopically. Bản đồ khu vực tương đồng và không tương đồng trong hai phân tử do đó có thể được xây dựng. Quá trình này được gọi là heteroduplex bản đồ.