Một lớp của các enzym mà làm suy thoái các phân tử DNA hoặc RNA bởi cleaving các trái phiếu phospho-diester liên kết liền kề nucleotide. Trong deoxyribonuclease (DNase), bề mặt là DNA. Trong endonuclease, nó cleaves tại các trang web nội bộ trong các phân tử của bề mặt. Dần dần, exonuclease cleaves từ khi kết thúc của các phân tử của bề mặt. Trong ribonuclease (RNase), bề mặt là RNA. Trong S1 nuclease, vận động viên bóng bề mặt là duy nhất-stranded DNA hoặc RNA. Nucleases có mức độ khác nhau của các đặc trưng cơ sở-trình tự, nhất cụ thể là hạn chế endonucleases.