通過改變一種凝膠體內部 pH 分離 DNA 或蛋白質的方法。分子遷移的電氣領域，他們會遇到變性的條件，降低他們的流動性。不同分子以不同的方式回應變性條件並因此反應在不同嚴重程度的變性劑 （導致損失的流動性在凝膠中的不同點）。