插入一個大的小的 DNA 分子 （通常通過同源重組) 重組進程。如果分子是圓的集成涉及到只有單一的橫穿 ； 如果是線性的然後兩個過境點以上所需。一個眾所周知的例子是 λ 噬菌體 （lambda） DNA 的整合入 E.大腸桿菌 基因組。