通过安装屏障物限制（基因改良过的）生物体的活动，以阻止其在实验室外生长。生物防范可有两种形式：使生物体无法在外部环境中生存，或使外部环境不适生物体居留。后者很少适合于细菌，一般而言，细菌可在几乎任何地方存活。因此，对于细菌和酵母，最好的方法是改变生物体内的基因，使其所需的特定营养通常只能在实验室才能获取到。如果它们脱离实验室，无法生长。使环境对生物体不利，一部分原因是为了生物控制，一部分原因是为了物理防治。因此，英国（那里对于水稻而言太冷而不利于生长）培育的一些首次经过基因改良的水稻品种，能够在美国亚利桑那州（那里气候太干燥）生长。生物防范还可能包含基因方面禁止使用的向量分子和寄助物，以便它们只能在实验者提供的特定环境下存活，而在实验室外则不能存活。