藉以本身转座子或插入序列插入到新的站点在同一或另一个进程的 DNA 分子。的确切机制仍未完全理解和不同的转座子可能由不同的机制转置。在细菌移位不需要转座子和 DNA 的目标之间广泛的 DNA 同源。这种现象因此被称为非婚生的重组。